我科学家率先绘就家蚕超级泛基因组图谱

你想去哪？

西南大学近日发布最新研究成果:家蚕基因组生物学国家重点实验室主任、国家蚕业产业技术体系首席科学家戴方银教授，完成了家蚕大规模种质资源的基因组分析，在国际上首次绘制了家蚕超泛基因组图谱，率先实现了家蚕遗传信息的数字化——“数字家蚕”。

家蚕是一种重要的经济昆虫和新兴的模式生物。以前只有单一参考基因组和部分重测序，不足以支持基因组变异和优秀基因的深度挖掘，尤其是分子育种。超泛基因组是一个物种所有基因组信息的总和，对于深化功能基因组研究和种质创新具有重要意义。

“家蚕的超级泛基因组图谱是一个涵盖了家蚕所有遗传信息的图谱。通过这个图谱，我们可以直接对接表现型和基因组代码。”比如，以前识别特定性状的基因或因果变异就像大海捞针，现在就像瓮中捉鳖，因为超泛基因组为此提供了“精细网格化”的“坐标”指导，就像专家查字典一样。

据西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室教授、博士生导师童晓玲介绍，研究团队对1078份家蚕种质资源进行了测序，其中包括47份野蚕、205份原蚕品种、194份实用蚕品种和632份突变体，并绘制了高精度的家蚕全基因组图谱。这个超级泛基因组包含了家蚕和家蚕最全的基因组信息，是世界上动植物领域最大的长阅读泛基因组。同时，团队还对家蚕的各种遗传变异、群体结构、人工选择、生态适应性、经济性状等进行了深入研究，取得了丰硕的创新成果。

蚕起源于中国，由中国的野蚕驯化而来，有5000多年的驯化历史。但其驯化起源是一个长期悬而未决的问题，尤其缺乏有力的生物学证据。本研究中的材料显示了世界上主要蚕桑区最丰富的遗传多样性。发现黄河中下游特有种在进化树上分布于蚕枝基部，说明蚕起源于黄河中下游。